Der Fehler lässt sich mit dem Befehl vgck, welcher die Konsistenz von VGs prüft, nachstellen:
sudo vgck WARNING: PV /dev/sda2 in VG derVolumeGroupName is using an old PV header, modify the VG to update. WARNING: PV /dev/sda5 in VG derVolumeGroupName is using an old PV header, modify the VG to update.
Lösung
sudo vgck --updatemetadata ubuntu-vg